Celebrul vanator de comori Ben Gates este de parere ca istoria e plina de secrete si ca indiciile care vor ajuta la dezlegarea lor se afla in jurul nostru si asteapta sa fie descoperite.
In partea a doua a filmului "Comoara nationala" Ben cauta sa dezlege misterul unuia dintre cele mai controversate asasinate din istoria Americii, cel al presedintelui american Abraham Licoln.
Ucigasul acestuia, John Wilkes Booth, pastra un jurnal care acum este descoperit. Insa cele 18 pagini care lipsesc din el sunt cheia dezlegarii misterului din jurul mortii presedintelui american.